| 熊伟,张晓娟,孙美涛,张海洋,徐彤.人线粒体转录终止因子2基因启动子区的生物信息学分析[J].井冈山大学自然版,2016,(1):51-56 |
| 人线粒体转录终止因子2基因启动子区的生物信息学分析 |
| BIOINFORMATICS ANALYSIS OF HUMAN MTERF2 GENE PROMOTOR REGION |
| 投稿时间：2015-10-12 修订日期：2015-12-02 |
| DOI：10.3969/j.issn.1674-8085.2016.01.011 |
| 中文关键词: 人线粒体转录终止因子2 启动子 转录因子 生物信息学 |
| 英文关键词: human MTERF2 promoter transcription factor bioinformatics |
| 基金项目:国家自然科学基金项目(31260276); 云南省教育厅科学研究基金重点项目(2014Z126); 大理大学博士科研启动基金项目(BSKY2012018); 大理大学大学生创新创业训练计划项目(201402) |
| 作者 | 单位 | E-mail | | 熊伟 | 大理大学基础医学院, 云南, 大理 671000
云南省昆虫生物医药研发重点实验室, 云南, 大理 671000 | xwailp@163.com | | 张晓娟 | 大理市第一人民医院, 云南, 大理 671000 | | | 孙美涛 | 大理大学基础医学院, 云南, 大理 671000 | | | 张海洋 | 大理大学基础医学院, 云南, 大理 671000 | | | 徐彤 | 大理大学基础医学院, 云南, 大理 671000 | |
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| 中文摘要: |
| 人线粒体转录终止因子2基因(mitochondrial transcription termination factor 2, MTERF2)在线粒体基因表达、细胞能量代谢及细胞周期调控过程中发挥重要作用,但MTERF2基因自身的表达调控机制仍不明确。通过生物信息学方法预测和分析人线粒体转录终止因子2基因启动子区的结构与功能,结果显示:人MTERF2基因全长9876 bp,含有3个外显子和2个内含子。基因上游5'端2500 bp的核苷酸序列存在3个启动子,启动子区序列中存在长为874 bp 的CpG岛,启动子区共发现244个转录因子结合位点。人MTERF2基因启动子区的生物信息学分析,提高了针对该基因启动子的研究效率,并为分析基因启动子的功能奠定了重要的理论基础。 |
| 英文摘要: |
| Human mitochondrial transcription termination factor 2 (MTERF2) plays an important role in mitochondrial gene expression, energy metablism and cell cycle regulation. However, the potential regulation mechanism of MTERF2 gene expression was still undiscovered. Online bioinformatics tools were used to analyze human MTERF2 gene's promotor. The results showed that the full length pf human MTERF2 gene was 9876 bp, which consist of three exons and two introns. There were three promoters in the 5' unconding region of human MTERF2 gene, two of which played a key role in the transcription of MTERF2. A 874 bp CpG island was found in human MTERF2 gene promoter region. In addition, total 244 transcription factor binding sites were found by AliBaba 2.1 protocol. Gene promoter related bioinformatics can improve the efficiency of human MTERF2 gene promoter research, and provide significant information for the prediction of gene promoter function. |
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